Partenaire Génoscope, CEA d'Evry

Contact

Genoscope, Institut de Génomique
CEA d'Evry
2 rue Gaston Crémieux CP5706
91057 Evry

Coordinateur du projet: Michaël Katinka

Genoscope
Institut de Génomique, CEA Evry

Expérience en rapport avec le projet

L'Institut de Génomique est dirigé par le Dr Jean Weissenbach et le Centre National de Séquençage (CNS) participe au projet Algomics. Le CNS est composé de 140 chercheurs, techniciens et personnel administratif. Parmi eux, environ 80% ont un contrat CEA, les autres viennent du CNRS, de l'INSERM, de l'INRA et de l'Université d'Evry.

Nos objectifs sont doubles:

  1. Fournir et offrir une plate-forme efficace et actuelle de clonage et de séquençage de projets avec des grandes quantités de données tant pour les communautés scientifiques françaises qu'internationales et,
  2. mise en évidence, description et classification de nouveaux génomes de bactéries de boue de stations de purification (Recherches au sein de l'UMR 8030).

La plupart de ces souches bactériennes ne peuvent pas être cultivées in vitro dans du milieu synthétique.

Mots clés

Génomique, séquençage à haut débit, ADNc, bioinformatiques

Equipements

La plate-forme de repiquage de colonies est composée de deux robots QPix et d'un robot QBot Genetix.
La plate-forme de séquençage est composée de quatre robots de distribution Caliper (trois robots Sciclone ALH 3000 et un ALH 500).
Notre capacité de séquençage est composée de 19 séquenceurs Applied Biosystems 3730xl 96 capillaires, un pyroséquenceurs 454 Roche et un séquenceur Illumina Solexa.